V ultrazvočnem sistemu merjenja pretoka obstaja veliko vrst virov motenj, ki povzročajo motnje, predvsem:

(1) V okolju namestitve merilnika pretoka lahko pride do velikih motenj električnega in magnetnega polja;

(2) Hrup v bližini ultrazvočnega signala, ki ga oddaja črpalka, ko je črpalka nameščena;

(3) Motnje hrupa napajalnika je mogoče odpraviti z uporabo običajno uporabljene tehnologije filtra moči;

(4) Interferenca oddanega in prejetega signala.Moč oddanega signala je velika, skozi vezje in zvok se lahko poveže s sprejemnim vezjem, če je premer cevi majhen, je razdalja med pretvornikoma zelo blizu, bo interferenčni rep razširil prejeto valovno obliko, tako resno vpliva na prejeti signal.